Todo bom RPG precisa de itens para manter o grupo vivo durante a batalha, e Pessoa 3 Recarregar não é diferente. As lojas funcionam de maneira diferente ao longo da série, mas os jogadores podem visitar uma farmácia padrão para conseguir o que precisam. Chama-se Farmácia Aohige, mas não é o único lugar onde os jogadores podem obter itens de cura.
