O que define Persona 3 Recarregar e outros jogos da franquia do resto dos JRPGs é seu elemento de simulação social. Os jogadores precisam melhorar seus relacionamentos com outros personagens para obter melhores estatísticas das Fusões de Personas, que envolvem o sacrifício de duas Personas para criar uma mais poderosa. Essa mecânica se chamava “Links Sociais”, mas foi alterada para “Confidentes” em Pessoa 5. Os Confidants oferecem os mesmos benefícios que os Social Links, mas com recompensas adicionais. Até Persona 3 Recarregar oferece tais recompensas por seus Links Sociais aprimorados, o que apenas prova que o sistema Confidant é o caminho a seguir para Pessoa 6 e futuras sequências.
