Ao contrário da maioria dos MMORPGs, onde os jogadores seguem um tipo de “construção” dependendo de sua classe, a mecânica em Phantasy Star Online 2: Nova Gênese adota o favorito dos fãs Estrela da Fantasia Classe + Subclasse Dinâmica. Como mostrado em ambos Phantasy Star Online 2 e a Nova Gênesis sequência, isso significa que os jogadores têm a opção de equipar duas (2) classes e atribuí-las como classes primárias e secundárias, com os personagens aproveitando os benefícios de ambas.
